南通市肿瘤医院消化内科为南通市临床重点专科，全科共有医师28人，其中博士9人（含博士在读），硕士8人，其中硕士生以上人员占60.7%，高级以上职称人员占53.5%，江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象（中青年学术技术带头人）1人，南通市“226高层次人才培养工程”培养对象1人，南通市青年医学重点人才1人。
科室配有核定床位（南北院）共104张，设有2个住院病区、1个日间病区、1个内镜室，共计6个诊疗小组，医疗辐射面广，收治的病人中70%来自南通地区，25%来自南通周边的泰州、扬州、盐城、淮阴、苏州等地区,5%来自外省市。科室配备腹腔热灌注仪、光动力治疗仪、普通电子胃镜、超细电子胃镜、电子十二指肠镜及微波治疗仪、射频治疗仪、沙氏食管狭窄扩张器等专科诊治设备，常规开展各种消化道恶性肿瘤的规范化诊治，能根据各种恶性肿瘤患者的不同基因表达状况开展个体化治疗和分子靶向治疗；常规开展药物基因组学（或药物遗传学）在个体化化疗中的应用，应用腹腔持续循环热灌注化疗治疗恶性腹腔积液；熟练开展电子胃镜尤其是无痛胃镜和超细胃镜的检查及内窥镜下良恶性食管狭窄扩张术和金属支架植入术、内窥镜下上消化道恶性肿瘤射频治疗术和肿瘤内注药术、内窥镜下胃息肉摘除术、十二指肠营养管放置术、内窥镜下取异物、消化道黏膜下注射止血、ERCP等技术，赢得了良好的社会效益。
在“科教兴科”的推动下，科室在科研方面取得了较为突出的成绩，科室的消化肿瘤诊治水平在省内享有很高声誉，深得广大病员的信赖，先后获得省、市级多项荣誉称号，科室还是南通大学医学院本科生、硕士研究生教学单位。自2013年获得《药物临床试验机构资格认定证书》以来，科室参加了由国家卫健委、上海肿瘤医院、江苏省肿瘤医院组织的十几种新药的临床试验，部分已经试验成功并顺利上市造福患者。
