两岸企业家峰会发端于江苏省南京市，在国务院台办、有关中央部委的关心指导和江苏省委、省政府的大力支持下，围绕深化两岸经贸合作和推动企业转型升级主题，南京市政府分别于2008年、2010年、2011年和2012年成功举办四届海峡两岸企业家紫金山峰会，受到了两岸各界的广泛关注。
随着两岸关系和平发展不断巩固深化，两岸经贸关系已经进入了一个新阶段，两岸产业的交流与合作也需要新思维、新做法。有鉴于此，两岸经济界迫切需要成立一个最具权威性、开放性、务实性的高端交流合作平台。在2012年的海峡两岸企业家紫金山峰会上，与会政经产学界人士发布共同倡议，建议在两岸分别成立两岸企业家峰会社团，除每年轮流在大陆及台湾举行年会之外，根据两岸企业界的实际需求设立产业合作推进小组，开展常态化的交流，以具体务实的方式推动两岸企业的交流合作和融合发展，进一步巩固和深化峰会年会成果。
在两岸双方的共同努力下，峰会组织化、机制化、长效化建设和峰会社团筹备工作取得扎实进展。2013年7月，两岸企业家峰会社团在北京市成立，同年7月，台湾两岸企业家峰会社团在台北市成立，300多位知名企业家和工商团体负责人加入各自峰会成为会员，选举产生双方峰会领导机构。曾培炎、萧万长分别当选双方峰会理事长，盛华仁、江丙坤分别担任双方峰会副理事长，并邀请一批两岸政经产学界知名人士担任峰会顾问和特聘专家。两岸峰会理事会分别下设宏观经济、能源石化装备、金融、信息家电、成长型和中小企业、文化创意、生物科技与健康照护等七个产业合作推进小组，由两岸相关主管部门前负责人和知名企业家担任召集人，开展经常性的交流互访和产业对接活动。至此，峰会与两岸经贸文化论坛、两会商谈、海峡论坛并列为两岸四大交流合作平台，成为以两岸企业家为主体，以汇聚企业家智慧、加强对话交流、深化产业合作为特色的两岸企业界最有影响的交流平台。
两岸企业家峰会社团自成立以来，秉持“推动两岸企业家之间的交流，推进两岸产业合作，深化两岸经济互利合作，维护两岸关系和平发展，振兴中华民族经济”的宗旨，分别于2013年在南京市、2014年在台北市、2015年在南京市、2016年在金门和厦门成功举办了四次峰会年会；并于2014年在台北举办了2014两岸自由经济示范区及自由贸易试验区对接研讨会，2015年在高雄举办了两岸中小企业合作创新发展论坛，2017年在东莞举办了2017两岸青年就业创业研讨会暨青创成果展览会。今年两岸企业家紫金山峰会将于11月6日-7日在南京市举行，这是两岸企业家峰会成立以后举办的第五次年会，来自海峡两岸的800多位企业领袖、工商团体负责人、中小企业家和青年创业者，将围绕“两岸产业融合发展：新形势、新商机、新思路”主题，针对多项具体议题进行深入交流，以期为两岸经济合作和产业融合发展提供新动力、探索新路径。
